近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上发表了题为“APIP5 functions as a transcription factor and an RNA-binding protein to modulate cell death and immunity in rice”的研究论文。该论文首次报道植物bZIP类型转录因子APIP5具有结合DNA和RNA的双重活性，在转录和转录后水平调控水稻细胞死亡和防御反应的新机制。

稻瘟菌（ Magnaporthe oryzae ）侵染引起的稻瘟病是水稻生产上最严重的真菌病害之一，挖掘水稻抗病功能基因并解析水稻与稻瘟菌互作机制，对开发病害防控新策略和选育抗病新品种具有重要意义。该团队前期研究发现水稻R蛋白Piz-t通过稳定APIP5抑制效应蛋白AvrPiz-t介导的细胞坏死（Wang et al., 2016  Current   Biology ），且APIP5能够转录抑制酚胺相关基因的表达调控酚胺代谢物的合成（Fang et al., 2021  Science Bulletin ）。然而，APIP5如何通过在细胞核和细胞质中穿梭精细调控水稻免疫反应的分子机制还不清楚。

APIP5蛋白包含核定位信号和核输出信号基序，核定位信号关键氨基酸的突变抑制了APIP5在水稻细胞核中积累，诱导细胞死亡的发生和增强对稻瘟菌的抗性。进一步发现在水稻发育后期APIP5在细胞核中的积累增加，利用染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）发现APIP5能够结合到细胞壁相关激酶 OsWAK5 和细胞色素P450酶 CYP72A1 的启动子，并抑制二者的表达。进一步发现OsWAK5 和CYP72A1分别通过调节木质素的积累和次级代谢物合成和活性氧爆发从而正调控水稻基础免疫反应。有趣的是，APIP5还具有结合RNA的活性，稻瘟菌侵染促进其在细胞质RNA加工小体中的富集，特异性地结合水稻抗病和细胞死亡相关基因 OsLSD1 和 OsRac1 的3'UTR的poly(U)序列，促进 OsLSD1 和 OsRac1 的mRNA降解，在转录后水平调控水稻基础免疫反应。因此，该研究明确了APIP5具有结合DNA和RNA双重功能，揭示植物转录因子通过在细胞核和细胞质中穿梭协同调控免疫反应的新机制，为水稻病害防控新策略的开发提供新思路。

中国农业科学院植物保护研究所博士后张帆为论文第一作者，中国农业科学院植物保护研究所宁约瑟研究员为文章的共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金和中国农业科学院创新工程等项目的资助。

水稻APIP5兼具转录因子和RNA结合活性调控细胞死亡和免疫反应

原文链接https://doi.org/10.1093/nar/gkac316