2007年11月12日，《国家重点基础研究发展计划》（973）“农业转基因生物安全风险评价与控制基础研究” 项目启动会议北京召开。科技部基础研究管理中心钱万强博士、农业部科技教育司唐婷女士、中国农业科学院刘旭副院长等部门的相关领导，973计划领域专家咨询组责任专家、北京市农林科学院张芝利研究员、中国农业科学院生物技术研究所贾士荣研究员出席会议并对项目在国家需求、学科建设等方面提出了希望和要求。项目专家组部分专家、中国农业科学院科技管理局陆建中处长、付长亮博士，中国农业科学院植物保护研究所陈万权副所长、科研管理与国际合作处郑传临处长以及项目所属各课题负责人和各    相关单位的学术骨干30多人参加了会议。我所所长吴孔明研究员和项目首席科学家彭于发研究员共同主持会议。
      项目首席科学家彭于发研究员汇报了项目总体情况、项目实施计划和项目经费情况，各课题负责人汇报了课题实施方案，就相关问题进行了讨论，分组学习了973计划项目组织实施的要求、财务管理有关规定及科技部2007年973项目实施会精神，探讨了本项目管理与交流模式。
      973计划“农业转基因生物安全风险评价与控制基础研究”项目由我所与中国科学院遗传与发育生物学研究所、浙江大学、中国农业科学院生物技术研究所、中国科学院水生生物研究所、湖南师范大学、中国疾病预防控制中心营养与食品安全研究所等单位共同承担，我所为项目依托单位，农业部为项目依托部门，项目前两年预算经费1590.64万元。该项目在国内外已有研究和上一期973计划“农业重要转基因生物安全性研究”项目圆满完成的基础上，又充分考虑了“转基因生物新品种培育”重大专项总体实施方案内容对转基因生物安全基础研究的科技需求和国家有关科技计划之间的相互配合，围绕外源基因引发非预期效应的分子机理、转基因生物对非靶标生物和生物多样性影响的生态规律、转基因产品食用安全性评价新模型等三个共性、关键科学问题，设置外源基因引发非预期效应的分子基础（主持人：中国科学院遗传与发育生物学研究所朱桢研究员）、转基因植物对动植物多样性影响的生态学规律（主持人：浙江大学叶恭银教授）、转基因生物对环境微生物影响的分子生态机理（主持人：中国农业科学院生物技术研究所陆伟副研究员）、靶标害虫抗性遗传演化机理（主持人：中国农业科学院植物保护研究所彭于发研究员）、转基因鱼适合度变化的生态学机理（主持人：中国科学院武汉水生生物研究所张堂林副研究员）、转基因动物生殖发育特性变化的生物学基础（主持人：湖南师范大学刘少军教授）和转基因产品食用安全性评价模型（主持人：中国疾病预防控制中心杨晓光研究员）等7个课题开展深入研究。
      根据《国家重点基础研究发展计划》相关规定，项目成立了项目专家组和项目管理办公室。项目专家组组长由项目首席科学家彭于发研究员担任，成员包括中国科学院院士、中国科学院水生生物研究所朱作言研究员，中国工程院院士、中国农业科学院植物保护研究所郭予元研究员，中国工程院院士、中国疾病预防控制中心陈君石研究员，中国农业科学院植物保护研究所吴孔明研究员，中国农业科学院生物技术研究所林敏研究员，中国科学院遗传与发育生物学研究所朱桢研究员和中国疾病预防控制中心杨晓光研究员。项目管理办公室挂靠在所科研管理与国际合作处。