蒙古科学院植物保护研究所（以下简称“IPP-MAS”）所长阿木吉日嘎拉博士一行于2008年10月13日访问中国农业科学院植物保护研究所（以下简称“IPP-CAAS”），双方表达了加强学术交流与合作研究的愿望。根据双方会议讨论结果的整理和进一步友好协商，达成科技合作协议。
      2009年1月15日和2月20日，吴孔明所长、阿木吉日嘎拉所长分别代表我所和蒙古国科学院植物保护研究所以函签形式签署科技合作协议，分中文、英文、和蒙文三种文本，每式两份，同等效力。双方各存中、英和蒙文一套。
      根据协议，双方同意建立有效合作伙伴关系，加强农作物有害生物监测和防控领域的科技合作工作，促进两国农物业生产的发展。主要在以下合作领域，开展科技合作：
      1、草原害鼠监测和防控技术的研究与应用；
      2、草原杂草监测和防控技术的研究与应用；
      3、草原虫害监测和防控技术的研究与应用；
      4、农业有害生物生防产品和技术的开发与应用。
     
具体合作方式如下：
      1、联合举办双边学术会议、学术报告等学术交流，开展人员培训活动，包括科技人员的培训，硕士和博士研究生的培养；
      2、鼓励在现有相关实验室之间的开展合作研究，建立科技合作关系，双方科学家可以到对方实验室工作一段时间，详细合作可以在此录框架下补充协议；
      3、双方科学家联合申请双方政府间和国际组织相关的国际合作项目。
      双方合作协议的签署为开展中蒙国际科技合作与交流提供平台。各相关课题组和研究室根据自身的实际情况，在此科技合作框架下积极寻求和开展我所与蒙古国科学院植物保护研究所的国际合作与交流。