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植保所研发快速鉴定恶性外来入侵杂草长芒苋草甘膦抗性水平的新方法

文章来源:农业入侵生物预防与监控创新团队      作者:王 瑞   点击数: 次      发布时间:2022-05-10

近日,中国农业科学院植物保护研究所农业入侵生物预防与监控创新团队在《Pest Management Science》在线发表题为“Reliable and rapid identification of glyphosate-resistance in the invasive weed  Amaranthus palmeri  in China”的论文。论文揭示了微滴数字PCR(ddPCR)在检测除草剂抗性基因拷贝数方面具有更高的准确性和特异性,是一种可靠、快速地鉴定入侵杂草长芒苋草甘膦抗性的新方法。

长芒苋原产于北美洲,目前已经传入到我国多个省市。为了能够快速鉴定入侵我国长芒苋的草甘膦抗性水平,准确区分抗性种群和敏感种群,制定精准高效的早期防控措施,该研究采用比较整株草甘膦剂量反应试验、实时荧光定量PCR(qPCR)和ddPCR检测草甘膦抗性基因5-烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合酶(EPSPS)基因拷贝数,三种方法评估长芒苋的草甘膦抗性水平的性能与效率,以筛选高效检测入侵植物除草剂抗性水平的方法。结果发现14个供试种群中,7个为抗性种群、7个为敏感种群,三种方法的检测结果基本一致,但是检测特异性存在差异。整株剂量反应试验费时费力,不适合入侵种群的除草剂抗性检测鉴定。qPCR抗性基因的拷贝数检测法相对快速高效,但需要已知的敏感种群作为对照。对新近入侵的外来植物而言,获得敏感种群通常非常困难。相反,ddPCR是一种直接检测基因拷贝数的新方法,不需要敏感种群作为对照,并且检测的准确性和特异性均优于qPCR。该研究首次利用ddPCR技术高效鉴定了长芒苋入侵种群的草甘膦抗性水平,为外来入侵植物抗药性水平快速鉴定提供了新方法,为高效精准防控入侵杂草提供了新思路。

中国农业科学院植物保护研究所博士生曹晶晶为论文的第一作者,王瑞副研究员为论文的通讯作者,硕士生吴乾美、万方浩研究员和郭建英研究员参与本研究。该研究得到了国家重点研发计划项目和国家自然科学基金等项目的资助。

原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ps.6843