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植保所完成天敌昆虫蠋蝽染色体水平基因组组装

文章来源:中美合作生物防治实验室      作者:刘晨曦   点击数: 次      发布时间:2024-09-11

近日,中国农业科学院植物保护研究所生物防治创新中心中美生物防治实验室通过PacBio和Hi-C等技术组装了高质量染色体水平的蠋蝽基因组。该参考基因组不仅为开展其生殖发育调控研究提供重要遗传基础,也为今后基于其营养吸收利用的扩繁技术及田间应用相关的逆境生理等分子机制研究提供了基因资源。相关研究结果在线发表在Nature旗下期刊Scientific Data。

蠋蝽 Arma chinensis ,属半翅目,蝽科,益蝽亚科,蠋蝽属,广泛分布于我国东北、华北、西北等地区。蠋蝽能够有效控制鳞翅目和鞘翅目的农林害虫,是一种优质的天敌昆虫。由于缺乏高质量基因组资源,限制了对蠋蝽生殖发育调控、营养吸收利用及逆境生理等分子遗传机制的深入研究。

该研究通过染色体核型分析确定了蠋蝽由7对染色体组成,综合运用PacBio、 HiSeq和Hi-C技术组装出蠋蝽基因组986Mb,Scaffold N50达到134.98 Mb,组装挂载7条染色体上,预测了20,853条蛋白编码基因,其中84.79%基因成功进行注释。此外,该研究还完成了蠋蝽卵、5个若虫龄期及成虫的发育阶段基因表达模式比较分析。

2022级硕士研究生付璐瑶为论文的第一作者,刘晨曦副研究员为论文的通讯作者,硕士生林昌进、徐文岩、程红梅、刘殿宇、马乐、苏之涵、严晓羽及长江大学董小林副教授参与了相关研究。该研究得到了美国农业部项目(59-0212-9-001-F)资助。



文章链接:https://www.nature.com/articles/s41597-024-03837-5